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华中农业大学边银丙教授领衔的羊肚菌课题组绘制迄今为止最大的真菌线粒体基因组

日期:2019-12-25 07:45
    近来,华中农业大学边银丙教授领衔的羊肚菌课题组发布了梯棱羊肚菌凯发k8娱乐真实地址线粒体物理图谱制作和进化剖析成果,论文宣布在International Journal of Biological Macromolecules上(IF=4.7)。这是课题组在梯棱羊肚菌(Morchella importuna)研讨范畴两年内宣布的第4篇SCI论文。      线粒体参加能量代谢、离子稳态、细胞变老和凋亡等事情。真菌线粒体基因组一般仅14个保存基因,基因组巨细在11 kb至235.8kb 。该研讨显现,梯陵羊肚菌线粒体基因组总长度272.2kp,这是迄今为止报导的最大的真菌线粒体基因组。除包括14个保存的线粒体编码蛋白、2个核糖体巨细亚基基因rRNA和32个tRNA外,还包括151个非保存线粒体ORF (ncORF)。保存蛋白、核糖体rRNA和tRNA总序列长度仅占基因组8.52%;ncORF总长度达89kb,占总长度的34%。令人意外的是,这些ncORF中108个基因在梯棱羊肚菌营养生长阶段处于活泼表达状况,暗示在梯棱羊肚菌线粒体基因组中或许具有某些特别功用。        梯陵羊肚菌超大的线粒体基因组中藏匿着很多散在重复序列,在10-5的比对阈值下总计有2216个重复单元,重复序列的总长度占基因组巨细的18.7%,部分较大的序列单元具有高复制的重复次数。这种高度重复的特征也导致线粒体拼装难度较大,课题组采用了一种迂回战略完成了de novo的拼装。
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